Die IPv6-Adresse gehört eindeutig zu Deiner FritzBox.
(Da sie die kodierte MAC-Adresse enthält, habe ich mir erlaubt, die textuell angegebene IPv6 in Deinem Post zu verschleiern.) 
Deine FB offeriert also ihre eigene IPv6 als lokalen DNS-Server.
Das erlaubt IPv6-fähigen Clients, Pi-hole über diese IPv6 zu umgehen.
U.U. kann es außerdem im Zusammenhang mit der gleichzeitigen Verwendung von Pi-holes Conditional Forwarding hier zu einer partiellen DNS-Schleife kommen.
Um das für IPv6 zu vermeiden, versuch bitte mal folgendes:
a. DNSv6-Server auch über Router Advertisement bekanntgeben (RFC 5006) nicht anhaken
b. DHCPv6 in der FRITZ!Box deaktivieren setzen und
b.1. Es sind keine anderen DHCPv6-Server im Heimnetz vorhanden setzen
Für den Betrieb von Pi-hole ist es ausreichend, wenn die FB nur dessen IPv4 als lokalen DNS-Server verteilt. Auch die Identifikation von Clients in Pi-holes Query Log wird dadurch einfacher, da Clients für ihre Anfragen nur noch von ihrer IPv4-Adresse aus stellen.
Die IPv6-Konnektivität wird dadurch nicht eingeschränkt, da Pi-hole unabhängig davon die dazu benötigten DNS-Anfragen vom Typ AAAA korrekt beantwortet.
Das funktioniert sowohl für Geräte, die nur IPv4 können, als auch für solche mit IPv4+IPv6-Anbindung (Dual Stack).
Für welche Upstream-DNS-Server ist Deine FritzBox konfiguriert?
(Internet | Zugangsdaten | DNS-Server)