Das hängt davon ab, ob Du Pi-holes client-basiertes Filtern für Dein iPhone verwendest.
Grundsätzlich ist die MAC-Adresse für die DNS-Auflösung völlig unerheblich.
Clients könnten bei jeder Netzwerkanmeldung ihre MAC ändern: DIe DNS-Auflösung wird einwandfrei funktionieren.
Da eine neue MAC in aller Regel auch eine neue IP nach sich zieht, würden natürlich auch neue IP-Adressen in Pi-hole's Query Log auftauchen.
Bei Verwendung von Pi-holes client-basierter Filterung sind allerdings die Gruppenzuordnungen für den neuen Client potentiell erneut (aus Pi-hole-Sicht erstmals) vorzunehmen, sofern das die MAC-Adresse randomisierende Gerät client-basiert gefiltert wurde.
Der entscheidende Faktor für eine Beanstandung sind Deine persönlichen Präferenzen. Wenn Du zufrieden bist, ist die Konfiguration für Dich optimal.
Eine universell optimale oder richtige Konfiguration gibt es nicht.
Konfigurationsvorschläge findest Du hier in den Foren reichlich, z.B. in Pi-Hole und FritzBox Setup Anleitung - #128 by Gert_Chlupaty.