Persönlich lasse ich mein Gastnetz nicht über Pi-hole laufen. Ich will meinen Gästen da nicht meine kompletten Filtereinstellungen aufzwingen. 
Ich schränke allerdings sehr wohl über die FB-eigenen Funktionen ein wenig ein, also nur Mail und Browser sowie BPjM- und eigene Blacklist.
Das kann und sollte aber jeder so machen, wie er es für richtig hält.
Für das Blocken von Port 53 in der FB hilft vielleicht auch ein Blick auf einen Post in Smarthome Steckdosen im pihole - #8 by Bucking_Horn.