In der Tat hat Pi-hole diese Datei früher mit nameserver 127.0.0.1 beschrieben.
Da so bei fehlerhafter Installation von Pi-hole überhaupt keine DNS-Auflösung mehr funktionierte und damit auch kein Download des Installations-Skripts oder fehlender Pakete und kein Upload von Debug-Logs, wurde das mit Pi-hole 5 geändert.
Du kannst jetzt also in /etc/resolv.conf eintragen, was für Dich optimal ist. 
jfb hat hierzu kürzlich gut erläutert, was man bei der Auswahl eines geeigneten Eintrags beachten sollte (allerdings in English).