Du solltest Dir vormerken, beim nächsten Update auf eine neue Pi-hole-Version Deine Berechtigungen und Eigentümer zu prüfen.
Generell würde ein Update die Berechtigungen im admin-Verzeichnis zurücksetzen.
In Deinem speziellen Fall bin ich mir nicht ganz sicher, da Du Pi-holes Web-Dateien in ein benutzerspezifisches Verzeichnis verschoben hast.