Sieht fast aus als würde dein DNS nicht funktionieren.
Geh doch mal in die /etc/resolv.conf und backup dir die Datei. Im Anschluss mal alles raus löschen und stattdessen
nameserver 1.1.1.1 eintragen. Datei speichern und im Pi /etc/init.d/networking restart eingeben und nochmal dein apt update versuchen.
Sollte das nicht funktionieren bin ich spontan ratlos. Du kannst dann aber die Datei wiederherstellen mit einem einfachen reboot von deinem PI oder aber in dem du das Backup wieder herstellst und nochmal /etc/init.d/networking restart eingibst.